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8 clients · secrets stay placeholders

JSON (mcpServers)Claude CodeCodexOpenCodeCursorVS CodeGemini CLIGoose

{
  "mcpServers": {
    "raras": {
      "type": "http",
      "url": "https://raras.org/api/mcp"
    }
  }
}

claude mcp add --transport http raras https://raras.org/api/mcp

[mcp_servers.raras]
url = "https://raras.org/api/mcp"

{
  "$schema": "https://opencode.ai/config.json",
  "mcp": {
    "raras": {
      "type": "remote",
      "url": "https://raras.org/api/mcp",
      "enabled": true
    }
  }
}

{
  "mcpServers": {
    "raras": {
      "type": "http",
      "url": "https://raras.org/api/mcp"
    }
  },
  "deeplink": "cursor://anysphere.cursor-deeplink/mcp/install?name=raras&config=eyJ0eXBlIjoiaHR0cCIsInVybCI6Imh0dHBzOi8vcmFyYXMub3JnL2FwaS9tY3AifQ%3D%3D"
}

{
  "servers": {
    "raras": {
      "type": "http",
      "url": "https://raras.org/api/mcp"
    }
  }
}

{
  "mcpServers": {
    "raras": {
      "httpUrl": "https://raras.org/api/mcp"
    }
  }
}

extensions:
  "raras":
    enabled: true
    name: "raras"
    type: streamable_http
    uri: "https://raras.org/api/mcp"
    timeout: 300

Quality 82 / 100good

protocol75 · weight 25

warn
protocol.modernnewest supported version is 2025-11-25; 2026-07-28 not supported, older versions are deprecated until 2027-07-28
n/a
protocol.statelessonly applies to 2026-07-28 servers
pass
protocol.transportstreamable HTTP
n/a
protocol.list_ttlonly applies to 2026-07-28 servers

authorizationn/a · weight 15

n/a
auth.prm, auth.as_metadata, auth.cimdno remote uses OAuth
n/a
auth.secret_in_urlno templated URL

tool hygiene79 · weight 30

pass
tools.descriptionsevery tool has a description
pass
tools.description_lengthdescriptions are concise
pass
tools.schemasevery tool has an object input schema
warn
tools.annotationsonly 10 of 20 tools declare readOnlyHint or destructiveHint
fail
tools.directory_hintsno tool declares all four of readOnlyHint, destructiveHint, idempotentHint and openWorldHint; missing: search_diseases (readOnlyHint, destructiveHint, idempotentHint, openWorldHint); get_schema (destructiveHint, idempotentHint); find_diseases_by_phenotypes (readOnlyHint, destructiveHint, idempotentHint, openWorldHint); …
pass
tools.token_costabout 1,953 tokens to load every tool
pass
tools.api_dumptools are not a one-to-one API dump

stability100 · weight 15

pass
stability.changesno tool changes in 30 days
pass
stability.rug_pullno tool changed its meaning under the same name

dependenciesn/a · weight 15

n/a
deps.known_vulns, deps.mcp_sdk_version, deps.resolvableno npm or PyPI package

20 tools, about 1,953 tokens to load them all · tool set 9af2e7b92dac · checked 2026-10-20 20:46 UTC

Tool changes

No tool definition changes recorded. A server's first observation is its baseline; later probes record what changes.

Checks run on what our credential-free, read-only probes observe; tools are never called and no code audit is performed. How it is computed.

Trust 90 / 100

provenance90

liveness100

freshness65

hygiene100

+repository +namespace-matches-repo +website +reachable +uptime-100% ~updated-152d-ago

Derived from observable signals (official registry feed and our own credential-free probes); no code audit performed. How it is computed.

Endpoints

remote	auth	reachable	uptime 30d	p50	protocol	last ok
`https://raras.org/api/mcp` streamable-http	none	yes	100%	674 ms	2025-11-25	2026-10-20

Tools (20)

`analyze_clinical_case`read-only	Caso clínico → doenças candidatas + literatura relevante em 1 chamada. Apenas informativo, nunca diagnóstico.
`explain_relation`read-only	Raciocínio fundamentado sobre o grafo: dada uma pergunta (ex.: "por que o gene X se associa à doença Y?", "como a droga Z se relaciona a esta doença?"), retorna caminhos de evidência multi-hop (doença↔gene↔via↔droga↔fenótipo) com proveniência citável. Se não houver caminho no grafo, recusa — nunca inventa.
`find_active_trials`	Trials ativos com filtro Brazil.
`find_diseases_by_phenotypes`	Match por IDs HPO. Use para diagnóstico diferencial.
`find_papers_for_disease`	Literatura relacionada a uma doença via embeddings (:SEMANTIC_MATCH, fallback vetorial).
`find_phenotypically_similar`read-only	Doenças com perfil de fenótipos HPO semelhante (simGIC pré-computado, explicável: nº de fenótipos em comum). Complementa find_similar_diseases (semântico).
`find_reference_centers`	Centros por doença e/ou UF, com CNES.
`find_similar_diseases`	Vector similarity via embeddings SOTA.
`get_disease_detail`	Fenótipos HPO, genes, SUS, trials, descrição clínica em PT.
`get_evidence`read-only	Cross-references de autoridade (Orphanet, MONDO, OMIM, MeSH, GARD, UMLS), status de verificação e PMIDs de uma doença. A base da regra "nunca inventar".
`get_graph_stats`	Contagens e métricas do dataset.
`get_hypotheses`read-only	Candidatos a reposicionamento de fármacos gerados por associação de genes (guilt-by-association): drogas que tratam outras doenças que compartilham genes com esta. HIPÓTESES para investigação, NUNCA recomendações clínicas — cada uma rastreável (via gene X, da doença Y).
`get_literature_relations`read-only	Relações tipadas extraídas da literatura biomédica (associate/treat/cause/inhibit/stimulate/prevent) entre a doença e genes/fármacos, com nº de publicações como proveniência. Filtrável por predicado.
`get_recent_updates`read-only	Doenças cujo gêmeo digital ganhou evidência nova (autoria, PubTator3, Open Targets, verificação) nos últimos N dias. Faça polling para acompanhar mudanças (substituto stateless de subscriptions).
`get_research_log`read-only	Registro cronológico do que o agente autônomo fez por esta doença: autoria, mineração de literatura, evidência genética, verificação, prospecção de fontes, recomputação de relações. Prova de que o gêmeo digital estuda a doença continuamente.
`get_schema`read-only	Node labels, relationship types e property keys do grafo. Use antes de cypher_query.
`get_sus_coverage`	CEAF, SIGTAP, PNTN, nível de integração.
`search_diseases`	Full-text search em 10.468 doenças raras. Suporta filtros SUS/trials.
`search_papers_semantic`	Busca vetorial sobre 424k papers do PubMed. Use caso clínico, pergunta ou conjunto de sintomas.
`search_phenotypes`read-only	Lookup HPO em PT-BR (encoder Araras-HPO-Brasil + léxico leigo) ou EN (vocabulário HPO). Retorna IDs HP: com estado de asserção: termo NEGADO ("nunca desmaiei") NÃO vira fenótipo. Outros idiomas não são cobertos. Limite de taxa: use poucas chamadas por minuto (429 = espere).

Schemas: list_tools.

Similar MCP servers

Official server.json

{
  "name": "io.github.rarasAI/raras",
  "$schema": "https://static.modelcontextprotocol.io/schemas/2025-12-11/server.schema.json",
  "remotes": [
    {
      "url": "https://raras.org/api/mcp",
      "type": "streamable-http"
    }
  ],
  "version": "0.2.0",
  "repository": {
    "url": "https://github.com/rarasAI/raras",
    "source": "github"
  },
  "websiteUrl": "https://raras.org/mcp",
  "description": "Disease Twin — Brazil's rare-disease knowledge graph (10,468) over MCP. Source-grounded, PT-BR."
}